| รหัสโครงการวิจัย |
|
|---|
| ปีงบประมาณ |
2561
|
|---|
| ประเภทโครงการ |
|
|---|
| ประเภททุน |
เพื่อแก้ปัญหาหรือสร้างความเข้มแข็ง
|
|---|
| ชื่อโครงการวิจัย |
ดีเอ็นเอบาร์โค๊ดเพื่อการระบุสายพันธุ์แมงกะพรุนน้ำจืด
|
|---|
| ชื่อโครงการวิจัย (EN) |
DNA Barcoding for Identification of Freshwater Jellyfish (Craspedacusta sowerbii)
|
|---|
| นักวิจัย |
|
|---|
| คณะ/หน่วยงาน |
คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี
|
|---|
| บทคัดย่อ |
การสกัดดีเอ็นเอมงกะพรุนน้ำจืด แล้วนำไปตรวจสอบคุณภาพ ด้วยวิธี 1% agarose gel electrophoresis พบว่า ดีเอ็นเอที่สกัดได้มีคุณภาพดี มีแถบขนาดใหญ่ที่ชัดเจน ปนเปื้อนด้วยโปรตีนและอาร์เอ็นเอเล็กน้อย สามารถนำไปใช้ในการเพิ่มปริมาณยีน COI ต่อไป ได้ด้วยปฏิกิริยา PCR ได้ผลผลิตที่มีขนาดประมาณ 650 คู่เบส และเมื่อเปรียบเทียบลำดับนิว คลีโอไทด์ของยีน COI ของแมงกะพรุนน้ำจืด โปรแกรม ClustalW พบว่า แมงกะพรุนน้ำจืดทั้ง 10 ตัวอย่าง นี้มีความยาวของยีนไม่เท่ากัน โดยมีความยาวอยู่ใน ช่วง 621-636 คู่เบส ซึ่งมีความยาวสั้นกว่า ที่มีรายงานในการศึกษาอื่นๆ ที่ผ่านมา การเปรียบเทียบความคล้ายคลึงของลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน COI ของแมงกะพรุนน้ำจืด จำนวน 4 ชนิด กับสิ่งมีชีวิตต่างๆ ในฐานข้อมูล GenBank และ BOLD โดยพิจารณาจากค่า % similarity พบว่า ในฐานข้อมูล ทั้งสองยังไม่มีรายงานลำนิวคลีโอไทด์ของยีน COI ในแมงกะพรุนน้ำจืดทั้ง 4 ชนิด แสดงว่าในปัจจุบันนี้ยังไม่มีการ ศึกษาถึงลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน COI ในแมงกะพรุนน้ำจืดทั้ง 4 ชนิดนี้ ทำให้สามารถเพิ่มข้อมูลลำนิวคลีโอไทด์ของ ยีน COI ในฐานข้อมูลทั้งสองนี้ได้
คำสำคัญ : ดีเอ็นเอ, บาร์โค๊ด, แมงกะพรุนน้ำจืด
The extraction of DNA and then this will bring to inspect the quality with the 1% agarose gel electrophoresis method, this is found that the extracted DNA will have the good quality. This will have the clear large size stripe which will contaminate with the protein and a little bit of RNA. This can bring to use in increasing the quantity of the COI gene further with the reaction of PCR which will get the productivity that has the size approximately at 650 conjugate acid-base pair and when this has compared the sequence of nucleotide of the COI gene of the freshwater jellyfish. The can find from the ClustalW program that 10 samples of freshwater jellyfishes will have the different length of genes. By this will have the length from 621 to 636 conjugate acid-base pair which will have the shorter length. This has reports in the past of other studies. There is the comparison of the resemblance of the sequence of nucleotide of the COI gene of 4 types of freshwater jellyfishes with other living things in the database of GenBank and BOLD. By this will consider from the value of % similarity, this is found that in both of 2 databases, this won’t have the report of the sequence of nucleotide of the COI gene in 4 types of freshwater jellyfishes. This has shown that in the current situation, there is no the study about the sequence of nucleotide of the COI gene in 4 types of freshwater jellyfishes. This will make to be able to increase the information of the sequence of nucleotide of the COI gene in this both of 2 databases.
Keywords : DNA, Barcoding, Freshwater Jellyfish
|
|---|
| คำสำคัญ |
ดีเอ็นเอ,บาร์โค๊ด,แมงกะพรุนน้ำจืด,DNA,Barcoding,Freshwater Jellyfish
|
|---|
| สถานะโครงการ |
ดำเนินการเสร็จสิ้น
|
|---|
| บทคัดย่อ |
|
|---|
| เล่มรายงาน |
|
|---|
| เปิดดู |
357 ครั้ง
|
|---|
